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瓊脂糖凝膠電泳回收PCR產(chǎn)物
發(fā)布時(shí)間:2021-11-01瀏覽次數(shù):1094返回列表
一.原理
DNA片斷的分離與回收是基因工程操作中的一項(xiàng)重要技術(shù),例如可收集特定酶切片斷用于克隆或制備探針,回收PCR產(chǎn)物用于再次鑒定等?;厥諏?shí)驗(yàn)中兩個(gè)重要的技術(shù)指標(biāo)是純度和回收率:前者未達(dá)標(biāo)時(shí)會(huì)嚴(yán)重影響以后的酶切、連接、標(biāo)記等酶參與的反應(yīng);后者不理想時(shí)往往會(huì)大大增加前期的工作量。
本實(shí)驗(yàn)采用的是V-GENE公司的DNA凝膠回收試劑盒,其原理是:在凝膠融化液(Buffer DE-A)中凝膠塊被迅速融化并釋放出DNA。加入高離液序列溶液(Buffer DE-B)后DNA片斷被選擇性吸附到silica膜上。經(jīng)Buffer W1、Buffer W2洗滌去除殘留在silica膜上的雜質(zhì)和高濃度鹽離子后,吸附到 silica膜上的DNA片斷經(jīng)微量水或Eluent洗脫下來(lái),即可用于各種分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。
二.材料與方法
1 材料
PCR產(chǎn)物(未經(jīng)純化)
2 儀器、用具
電泳儀、電泳槽、凝膠樣品梳、微波爐、臺(tái)式離心機(jī)、移液器、恒溫孵育器(55-65℃)、1.5ml 離心管
3 試劑
1×TAE電泳緩沖液;溴化乙錠溶液(EB)[有毒,小心操作] ;瓊脂糖;6×加樣緩沖液;NJ 緩沖液;DNA洗脫緩沖液;SPW洗滌緩沖液
2.4 方法
(1) 按常規(guī)方法于2%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳。
(2) 在紫外燈下切下含有目的DNA的瓊脂糖凝膠,用紙巾吸盡凝膠表面液體。
(3) 稱(chēng)量凝膠重量,以1mg=1μl換算凝膠體積。
(4) 加入3個(gè)凝膠體積的NJ緩沖液
(5) 懸浮均勻后于55℃-65℃加熱7min,期間每2—3min搖晃一次,直至凝膠塊完全融化。
(6) 把DNA—瓊脂糖溶液加到一個(gè)Mu-Pu DNA回收純化柱上,并把柱子裝在一干凈的2ml收集試管內(nèi),14000rpm離心1ml,棄去流出液。對(duì)于體積大于700μl 的樣品,則分別加到不同的柱子上,每次700μl。
(7) 用700μl無(wú)水乙醇稀釋的SPW洗滌緩沖液洗滌柱子,加入柱子中后靜置2-3min。室溫下14000rpm離心1min。
(8) 棄濾液,以同樣的方法再洗滌一次。
(9) 把柱子裝在一個(gè)滅菌干凈的1.5ml 離心管上,加入30-50μl的DNA洗脫緩沖液或無(wú)菌去離子水到柱基質(zhì)上,14000rpm離心1min以洗脫出DNA。
(10) 取3μl樣品,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)回收結(jié)果。
注:PCR產(chǎn)物的純化選用直接純化法還是膠回收法主要取決于PCR產(chǎn)物。若PCR產(chǎn)物電泳時(shí)為單一條帶,可采用直接純化法,即將酶、dNTP等多余物質(zhì)去掉便可;若PCR產(chǎn)物電泳時(shí)為多條帶,則要根據(jù)需要回收特定條帶,此時(shí)須選用膠回收法