色譜柱由柱管、壓帽、卡套（密封環(huán)）、篩板（濾片）、接頭、螺絲等組成。柱管多用不銹鋼制成，壓力不高于70 kg/cm2 時，也可采用厚壁玻璃或石英管，管內(nèi)壁要求有很高的光潔度。為提高柱效，減小管壁效應，不銹鋼柱內(nèi)壁多經(jīng)過拋光。也有人在不銹鋼柱內(nèi)壁涂敷氟塑料以提高內(nèi)壁的光潔度，其效果與拋光相同。還有使用熔融硅或玻璃襯里的，用于細管柱。色譜柱兩端的柱接頭內(nèi)裝有篩板，是燒結(jié)不銹鋼或鈦合金，孔徑0.2~20μm(5~10&μm)，取決于填料粒度，目的是防止填料漏出。北京綠百草科技發(fā)展有限公司技術(shù)人員建議，使用色譜柱須留意下列的一些細節(jié)：
    1、將色譜柱接到色譜儀之前，必須先用合適的溶劑沖洗流路（包括流通閥和定量環(huán)）。 如之前是反相系統(tǒng)，先用水把系統(tǒng)中可能含有的鹽沖洗干凈，再用異丙醇以2ml/min沖洗1小時左右，再接色譜柱。
    2、有些溶劑（比如丙酮、氯仿、DMF、二甲基亞砜、乙酸乙酯、二氯甲烷、THF）會破壞手性固定相，應禁用。 
    3、如果使用的是自動進樣器，進樣間隔的沖洗液也必須更換成合適的溶劑。
    4、接色譜柱之前，充分沖洗系統(tǒng)。
    5、避免使用除正己烷，異丙醇，乙醇之外的其他溶劑，如樣品中含有其他溶劑也需注意。
    6、壓力建議在50Bar以下，高不能超過100Bar。
    7、樣品檢測前需仔細詢問送樣人員樣品中可能含有的溶劑，如果工藝中用到丙酮、氯仿、DMF、二甲基亞砜、乙酸乙酯、二氯甲烷、THF，則需盡量烘干。樣品盡量溶解在流動相中，并用0.45μm濾膜過濾。不能使用強堿性物質(zhì)作為流動相添加劑或者溶解樣品，因為這樣會損壞填料中的硅膠成分。 
    8、如果系統(tǒng)中或者色譜柱中含較高濃度的異丙醇或者乙醇時，由于他們的粘度比較大，平衡色譜柱時需特別注意壓力變化，可采用低流速平衡，當柱壓下降后再逐漸升高至要求的流速。 
    9、樣品檢測完畢，用無水乙醇清洗色譜柱，以0.5ml/min沖洗3個小時。用無水乙醇柱壓會比較高，所以流速不能過高，沖洗過程中注意壓力變化，如超過50bar，則把流速降至0.3ml/min，并適當延長沖洗時間。 
    10、若色譜柱處于長期閑置狀態(tài)時，要將色譜柱沖洗，建議沖洗3-4小時以上，后保存在純有機試劑或高比例的有機試劑溶液（如90%甲醇水）中。