RNA建庫(kù)試劑盒上線,誰(shuí)才是真正的幕后玩家
發(fā)布時(shí)間:2019-07-18瀏覽次數(shù):1024返回列表
RNA建庫(kù)試劑盒產(chǎn)品,適合于illumina測(cè)序平臺(tái),試劑盒中的每種組分都經(jīng)過(guò)了嚴(yán)格的質(zhì)量控制。
建庫(kù)流程
利用oligo dT磁珠,從總RNA純化得到mRNA,經(jīng)過(guò)片段化(300bp左右)、合成一鏈和二鏈cDNA,再通過(guò)末端修復(fù)、加A、連接接頭和PCR富集得到zui終的cDNA文庫(kù)。
Tips:RNA樣品檢測(cè)的4種主要方法
(1) 瓊脂糖凝膠電泳分析RNA降解程度以及是否有污染
(2) Nanodrop檢測(cè)RNA的純度(OD260/280比值)
(3) Qubit對(duì)RNA濃度進(jìn)行定量
(4) Agilent 2100檢測(cè)RNA的完整性
適應(yīng)范圍
樣本種類:動(dòng)、植物及真菌等真核生物的總RNA
建庫(kù)起始量:100ng-1.5μg,推薦RNA RIN值≥7
插入片段:150bp-200bp或250-300bp
注:以1.5μg小鼠總RNA為起始模板,caliper檢測(cè)文庫(kù)大小分布情況,主峰值在408bp左右
溫馨提示:
(1)RNA純化在室溫條件下操作,RNA樣本稀釋后冰上放置,并盡快進(jìn)入下一步實(shí)驗(yàn),避免RNA發(fā)生降解;
(2)RNA打斷條件以及后續(xù)片段篩選需要嚴(yán)格按照sop進(jìn)行,否則會(huì)影響文庫(kù)大小及產(chǎn)量;
(3)試劑盒中的產(chǎn)品組分,不可拆分,不可與其他品牌同種試劑配套使用,否則影響建庫(kù)結(jié)果。
RNA建庫(kù)試劑盒注意事項(xiàng)
1、試驗(yàn)前請(qǐng)仔細(xì)閱讀本說(shuō)明書(shū),注意每個(gè)組分的保存溫度,確保實(shí)驗(yàn)順利完成。
2、Stranded Oligo需-80℃保存,使用時(shí)少量分裝使用。
3、操作過(guò)程請(qǐng)注意避免核酸樣品和產(chǎn)物之間的交叉污染。
4、請(qǐng)使用不含RNA酶或DNA酶的槍頭、EP管進(jìn)行試驗(yàn)。
5、建庫(kù)所使用的RNA必須是純化后質(zhì)檢合格的樣本,否則會(huì)嚴(yán)重影響建庫(kù)結(jié)果;
6、實(shí)驗(yàn)所用磁珠應(yīng)提前30分鐘自4℃環(huán)境中取出,平衡至室溫。所有磁珠操作均需置于室溫。
7、80%乙醇需現(xiàn)配現(xiàn)用,用其清洗磁珠后,需清除干凈,避免對(duì)后續(xù)反應(yīng)產(chǎn)生影響。
建庫(kù)流程
利用oligo dT磁珠,從總RNA純化得到mRNA,經(jīng)過(guò)片段化(300bp左右)、合成一鏈和二鏈cDNA,再通過(guò)末端修復(fù)、加A、連接接頭和PCR富集得到zui終的cDNA文庫(kù)。
Tips:RNA樣品檢測(cè)的4種主要方法
(1) 瓊脂糖凝膠電泳分析RNA降解程度以及是否有污染
(2) Nanodrop檢測(cè)RNA的純度(OD260/280比值)
(3) Qubit對(duì)RNA濃度進(jìn)行定量
(4) Agilent 2100檢測(cè)RNA的完整性
適應(yīng)范圍
樣本種類:動(dòng)、植物及真菌等真核生物的總RNA
建庫(kù)起始量:100ng-1.5μg,推薦RNA RIN值≥7
插入片段:150bp-200bp或250-300bp
注:以1.5μg小鼠總RNA為起始模板,caliper檢測(cè)文庫(kù)大小分布情況,主峰值在408bp左右
溫馨提示:
(1)RNA純化在室溫條件下操作,RNA樣本稀釋后冰上放置,并盡快進(jìn)入下一步實(shí)驗(yàn),避免RNA發(fā)生降解;
(2)RNA打斷條件以及后續(xù)片段篩選需要嚴(yán)格按照sop進(jìn)行,否則會(huì)影響文庫(kù)大小及產(chǎn)量;
(3)試劑盒中的產(chǎn)品組分,不可拆分,不可與其他品牌同種試劑配套使用,否則影響建庫(kù)結(jié)果。
RNA建庫(kù)試劑盒注意事項(xiàng)
1、試驗(yàn)前請(qǐng)仔細(xì)閱讀本說(shuō)明書(shū),注意每個(gè)組分的保存溫度,確保實(shí)驗(yàn)順利完成。
2、Stranded Oligo需-80℃保存,使用時(shí)少量分裝使用。
3、操作過(guò)程請(qǐng)注意避免核酸樣品和產(chǎn)物之間的交叉污染。
4、請(qǐng)使用不含RNA酶或DNA酶的槍頭、EP管進(jìn)行試驗(yàn)。
5、建庫(kù)所使用的RNA必須是純化后質(zhì)檢合格的樣本,否則會(huì)嚴(yán)重影響建庫(kù)結(jié)果;
6、實(shí)驗(yàn)所用磁珠應(yīng)提前30分鐘自4℃環(huán)境中取出,平衡至室溫。所有磁珠操作均需置于室溫。
7、80%乙醇需現(xiàn)配現(xiàn)用,用其清洗磁珠后,需清除干凈,避免對(duì)后續(xù)反應(yīng)產(chǎn)生影響。